Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Tdrd5Q5VCS6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Tdrd5Q5VCS6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms