Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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