Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab42Q0PD08 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms