Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms