Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms