Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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