Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms