Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms