Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms