Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms