Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms