Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoa1Q00623 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms