Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms