Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps3aP97351 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms