Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms