Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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