Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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