Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms