Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms