Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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