Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NapbP28663 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NapbP28663 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NapbP28663 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms