Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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