Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms