Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SftpcP21841 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms