Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pou5f1P20263 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 843.9 ms