Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnnc1P19123 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms