Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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P18529 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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P18529 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18529 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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P18529 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18529 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18529 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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