Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18524 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18524 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18524 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18524 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18524 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18524 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18524 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms