Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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