Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms