Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
DmdP11531 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
DmdP11531 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
DmdP11531 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
DmdP11531 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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DmdP11531 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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DmdP11531 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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DmdP11531 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DmdP11531 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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DmdP11531 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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