Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P10404 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P10404 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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P10404 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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P10404 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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P10404 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P10404 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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