Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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