Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sp100O35892 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Sp100O35892 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms