Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atf6bO35451 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atf6bO35451 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atf6bO35451 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atf6bO35451 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atf6bO35451 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atf6bO35451 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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