Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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