Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21897J3KMP5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21897J3KMP5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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