Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms