Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms