Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms