Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pagr1bF6V0H0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms