Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Myo5cE9Q1F5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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