Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Srp54bE9PXC0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms