Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms