Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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