Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Prr29B1ARI9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Prr29B1ARI9 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Prr29B1ARI9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Prr29B1ARI9 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Prr29B1ARI9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Prr29B1ARI9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Prr29B1ARI9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Prr29B1ARI9 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Prr29B1ARI9 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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