Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Scn3aA2ASI5 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Scn3aA2ASI5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Scn3aA2ASI5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scn3aA2ASI5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Scn3aA2ASI5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Scn3aA2ASI5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
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Scn3aA2ASI5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Scn3aA2ASI5 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Scn3aA2ASI5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn3aA2ASI5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn3aA2ASI5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn3aA2ASI5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn3aA2ASI5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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