Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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