Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac6Q9Z2V5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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