Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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